A história mostra a luta de Saya Kisagiri (o nome igual ao da protagonista de Blood+, Saya Otonashi) contra seres conhecidos como furukimono. Estes seres se alimentam de seres humanos, por isso ela precisará proteger a sua escola e até mesmo toda a cidade, contra essa ameaça. Vale lembrar que a ordem cronológica dessa série é após Blood+ (mas não é preciso assistir Blood+ primeiro, já que elas não possuem ligação).
