O fotógrafo freelancer Mikogami Hayato volta à sua cidade natal Ootomo para investigar boatos de um homem que usa uma máscara de caveira para cometer assassinatos. Quando chega na cidade, descobre uma ligação entre as vítimas e uma nova seita religiosa (Byakureikai), uma empresa local farmacêutica e estranhas criaturas metade humana, metade animal. Então com uma jovem fotógrafa, ele decide descobrir quem é realmente o Skull Man.