Em 2015 a humanidade enfrenta uma ameaça: seres misteriosos chamados Anjos semeiam o pânico e a destruição por onde passam. Com o intuito de deter esta ameaça fatal, as Nações Unidas encarregaram a organização secreta Nerv de criar andróides gigantescos, os Evangelions, cuja missão é proteger a raça humana.