A história conta sobre Asakura Yoh, um garoto que nasceu em uma das mais tradicionais famílias "shaman" do Japão. Por definição, "shamans" são pessoas capazes de comunicarem-se com espíritos, e possuem o dom de vê-los. A história começa quando Yoh vai para Tokyo à procura de um poderoso espírito que fosse seu parceiro para que, assim, pudesse disputar o Shaman Fight. Mas a real importância desta competição é que esta só ocorre a cada 500 anos, e nesta disputa se descobre o "Shaman King", um "shaman" com grande poder, capaz de se comunicar com o Grande Espírito e, junto com este, guiar o mundo para um caminho melhor. Yoh se alia ao espírito de um grande samurai chamado Amidamaru, e ambos iniciam a sua batalha. O principal objetivo de Yoh em tornar-se o campeão é simplesmente poder ficar amigo do Grande Espírito e, desse modo, viver o resto de sua vida sossegado. Um enredo repleto de reviravoltas e conspirações irá marcar o ritmo dos episódios.