Yukiteru Amano é um aluno de ensino médio que costuma registrar todos os acontecimentos de sua vida, por mais rotineiros que sejam, em um diário no seu telefone celular. Certo dia um de seus amigos imaginários, Deus Ex Machina, surpreende-o mostrando ser real e concedendo a seu diário a capacidade de prever o futuro próximo.A trama é de um jogo de sobrevivência de 12 pessoas escolhidas pelo Deus para ser o seu sucessor. Utilizando o Mirai Nikki(Diário do Futuro), que é um celular especial que descreve os acontecimentos do futuro, os 12 escolhidos terão que participar do jogo de matar ou morrer até restar um único sobrevivente.