Shion no Ou conta a historia de uma jovem chamada Ishiwatari Shion. Quando tinha 4 anos os pais de Shion foram assassinados em sua casa. A policia não encontrou nada na cena do crime á excepção de um tabuleiro de shogi em que as peças foram alinhadas de forma ordenada. Shion ficou em choque de ver os pais mortos caidos no chão sobre uma poça de sangue o que resultou na perda da sua voz. Os vizinhos da família Ishiwatari, a familia Yasuoka adotaram Shion depois do assassinato e criaram-na como se fosse filha deles e mudarem seu nome para Yasuoka desde então. O pai adoptivo de Shion é um jogador profissional de shogi e ao longo dos anos depois do assassinato, ele ensinou Shion a jogar shogi. Ela tornou-se numa jogadora profissional genial tal como o seu novo pai. A historia é sobre como a escolha dela em ser jogadora profissional de shogi pode um dia levá-la a encontrar o assassino dos pais passados 8 anos do assassinato.
