Okajima Rokurou, agora conhecido como "Rock", costumava ser um típico homem de negócios no Japão. Então, durante uma viagem de negócios rotineira, ele é raptado e, posteriormente, incorporado à Companhia Black Lagoon; um grupo pirata de mercenários que não são necessariamente criminosos, e atuam em uma cidade chamada Roanapra. Descartado por seu chefe, ele resolve juntar-se a essa Companhia. Agora ele se vê obrigado a flutuar entre as políticas inconstantes do submundo do crime, enquanto tenta evitar a morte que o cerca juntamente com a sua companheira de trabalho, a "Gatilho Duplo" Revy.
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