A protagonista da trama é Kurosu Yuuki, uma garota que ainda na sua infância, foi atacada por um vampiro numa chuvosa noite de inverno. A menina acabou sendo salva por Kaname Kuran, um outro vampiro. Essa é a única lembrança que Yuuki tem do seu passado. Com a morte de seus pais, Kaname decide levar Yuuki para o Cross Academy. A instituição aceita tanto vampiros como humanos em suas instalações. A única limitação é que o período diurno é reservado aos humanos, enquanto o noturno para os vampiros. Os vampiros que ingressam na academia, juram nunca mais atacar nenhum humano. O grande desejo da Cross Academy é um dia construir um mundo, onde as duas raças possam conviver juntas.